陆荣廷对辛亥革命的爆发并没有什么准备,因此在革命之初他一度被动,但他毕竟在政军两界摸爬滚打了这么多年,凭借手中的军队,他很快就获得了广西督军的位子,把广西省会从桂林迁到了他的老巢南宁.陆荣廷虽然宣布独立并当上广西都督，但是这并非他赞成共和，倒向革命，尽管孙中山曾派潘乃德和陆荣廷联系，希望广西出兵北伐，一连几次，但他都以各种借口推托，他急于要做的事，就是扩展自己的势力，巩固自己在广西的统治。他招抚各路绿林队伍，如沈鸿英等部，改编为桂军。另外，他大量安排自己的亲信心腹，控制和指挥军队，除了陈炳焜 、谭浩明、莫荣新、韦荣昌、沈鸿英、林俊廷等人外，陆裕光、陆福祥、陆德标、马济、韩彩风等，既是他的义子和养子，又是他军队中的重要将领。由于他的极力扩张和经营，桂军很快成为西南地区一支重要的军阀队伍。
袁世凯当政后,陆荣廷对袁世凯一面效忠一面又处处防范,由于广西同云南一样地处西南边陲,袁世凯同样鞭长莫及,他和唐继尧一样成功的保持了自己的实力,广西同云南一样的贫瘠,因此陆荣廷和唐继尧一样有着强烈的扩张**,所不同的是唐继尧企图控制四川,而陆荣廷企图控制富庶的广东.但是在袁世凯称帝遭到全国的一片反对后,陆荣廷认清形势,果断的打起了护国的大旗.1916年3月15日，陆荣廷在柳州发布护国讨袁通电，宣布广西独立。陆荣廷宣布反袁，给袁世凯重大打击.为加强各派反袁力量的联合，西南护国各省，于5月8日在广东肇庆组织护**务院，唐继尧、岑春煊出任正、副抚军长，陆荣廷、陈炳焜 代表广西出任抚军，军务院成为后来南方护法政府的前身.接着，陆荣廷亲率部队一万人，取道柳州、桂林、全县直指湖南，配合云南护**向北洋军进攻。
袁世凯死后，黎元洪继任大总统，任命陆荣廷为湖南都督。陆荣廷知道自己难以控制湖南，他所图的是两广地盘，所以并不受命，荐谭延铠代。北京政府于7月6日改任陆荣廷为广东督军，陈炳焜为广西督军，这才合符他的心意。当时，护国战争结束，军务院也于7月14日宣布撤销。于是，陆荣廷率莫荣新、谭浩明、马济等军南下广东，围攻龙济光于广州，迫使龙济光退居琼崖，9月中旬解决了广东。就这亲，陆荣廷利用护国战争之机，控制了两广，成了西南地区炙手可热的一方军阀。
段祺瑞当政后企图统一全国,这样控制西南各省的唐和陆就成为他的巨大障碍.于是为了保存地盘,陆荣廷先宣布两广自主,接着又和唐又果断的打起了护法的大旗,邀请孙中山南下护法. 1917年7月6日，孙中山与廖仲恺、朱执信等南下广州，联合滇桂军阀，举起了维护《临时约法》的旗帜。7月21日，北京海军总长程璧光和海军第一舰队司令林葆怿也联名通电，响应孙中山的护法号召，率舰队南下广州。8月25日，非常国会在广州召开，通过《中华民**政府组织大纲》，成立护法军政府，选举孙中山为大元帅。军政府虽承认北京政府为在国际上代表全中国的中央政府,但是却不受其节制,在军政府的领导下,滇桂军阀同北方军阀展开了断断续续长达三年的南北战争.
1918年以后,南北战争进入了谈谈打打的阶段,陆荣廷为了巩固权力,就开始准备同北方和谈,接着他又于1918年4月10日，通过各种方法使非常国会通过了《修正军政府组织法》，改大元帅首领制为七总裁合议制，由唐绍仪、伍廷芳、孙中山、岑春煊、陆荣廷、唐继尧、林葆怿为总裁，旋即推举岑春煊为主席总裁。改组后的这政府完全由桂、滇军阀及其附庸政客控制，护法成为空名。孙中山见状，于5月4日辞职，5月21日离穗赴沪。该年5月陆荣廷突然下手除掉了入粤的滇军,此后他又急要剪除陈炯明、许崇智等粤军。
不想此时适值北洋军阀派兵从福建进攻潮汕，广东告急.早在护法军政府改组前，孙中山就想建立听命于自己的一支陆军，于是就和省长朱庆澜商量，拨出省长亲军中的二十营粤籍军队，由陈炯明率领“援闽”。桂系军阀对此事始则加以阻挠，继则因潮梅镇守使莫擎宇投靠段祺瑞，宣布独立，形势危急，勉强同意。陆荣廷此时亦想借此排挤国民党的势力出广东，利用粤军去和北洋军阀互相厮杀，以坐收渔人之利.不想该部粤军自成立后连战连捷,先后占领了闽西南的汀州、漳州、龙岩等地，立住了脚跟。1919年6月，皖系为对付直系的威胁，指使其福建督军李厚基与陈炯明的援闽粤军达成停战协定和划界协议。此后，粤军利用停战机会，从事扩编整训，发展兵员至二万人，编成两个军，以陈炯明为总司令兼第一军军长，许崇智为第二军军长，邓铿为总部参谋长,自此改部粤军又成陆荣廷的心腹大患,令其寝食难安.
正如唐继尧和直系吴佩孚又密约一样,陆荣廷也和吴佩孚有密约,他们相约‘南倒孙,北倒段‘.在北方爆发北京战争和西南爆发倒熊之战后,陆荣廷也开始准备发动对粤军的战争.1920年3月，孙中山特派朱执信、廖仲恺到漳州，力速陈炯明回师广东，肃清桂系军阀，建立广东革命根据地。孙中山同时派绍桢回广东，在江门等地领导民军起义，配合粤军回粤。5月,直皖战争爆发,桂系认为时机已到，乃于5月10日通过军政府下了进攻福建粤军的动员令，以沈鸿英为总司令，分三路进攻粤军。陈炯明听到桂军进攻的消息，立即做出回应,准备拼死一战,粤桂战争（又称两广战争）爆发。蒋介石此时受孙中山之命从上海重返军界,参加陈炯明的部队进军广东。
1920年的战争充满令人难以预料的事,正如北方皖系不胜而胜,直系不败而败一样,在两广战场以为会胜利的却不断失败,以为失败的却取得了令人意外的胜利.5月14日，粤军分三路进攻桂军,同时由于桂系治粤四年，作恶多端，广东人民恨之入骨，各地民军也起义响应,纷纷支援粤军回师。广东地方派军人李福林、魏邦平等又宣布脱离桂系。于是，桂军兵败如山倒，狼狈溃退。粤军于7月10日攻克广州,桂军残部逃回广西。此时的孙中山正准备重返广东了吧,但是我却不可能再插手南方事务了,在我的远较近攻的战略中,新疆远比南方重要的多,我出兵南方一是为了捞取和平使者的名声,而也是为了借机在南方造成有利于我的局面,随着西南的平定,南方一断了一臂,南方的重要性迅速的降低了,而此时发生的新疆叛乱已经给了我进入新疆的天赐良机,为了筹集军队进入新疆,我已在考虑是否要撤回入关军队了.
新疆从来就是中国的西北前哨,这里是中国通往西方的陆地桥梁,战略地位极其重要,自清末名将左中堂收复新疆后,新疆开始设立行省.这里在前清是俄国的势力范围,正如东北一样,而占据了印度的英帝国也企图染指这里.辛亥革命后，民国政府的总统、总理就像走马灯一样更迭，中央政府无力西顾,杨增新剪掉辫子，由清政府新疆的镇迪道、提法使一跃而成为新疆的省长、督军.但杨增新的政治思想同内地各省迥然不同,他是个保守的人,因此从不主动变革,他不信任军队,他崇尚权术而不是武力,在他的治理下,新疆呈现出了一种独特的模样.
1912年，杨增新继袁大化任新疆省都督之际，内忧外患不已。先说内忧：东境哈密维吾尔族人铁木耳和吐鲁番农民穆依登先后聚众生变，并杀害镇西道尹易盛福；南境哥老会徒杀官劫库发动叛乱；革命党人四出活动反抗都督府；西北境伊犁独立问题方兴未艾。再看外患：沙俄策动外蒙王公贵族“独立”后，继而又发动科（科布多）阿（阿勒泰）战乱并一面增兵边境，对我虎视眈眈，一面在南疆各地非法发展俄侨。还有英国也援引沙俄先例，在南疆中国人中非法发展侨民。欧战爆发后，苏俄哈萨克20余万饥民为逃避红党(也就是布尔什维克)迫害，相率流窜至新疆，继而白党数万败军分由伊犁、塔城、阿山进入新疆请求庇护。